El área de salud integral de la FELGTB trata de abordar el concepto de salud, siguiendo las indicaciones de la Organización Mundial de la Salud, más allá de la mera ausencia de enfermedad.

Para nosotros y nosotras la prevención del VIH-SIDA ha sido y es un elemento fundamental de nuestra acción social y política, del mismo modo es muy importante luchar por el bienestar de las personas seropositivas y conseguir mejoras en su calidad se vida y erradicar la discriminación social que, en muchos casos, sufren. El movimiento asociativo lgtb continúa siendo vanguardia en la lucha contra el sida y la FELGTB y sus asociaciones han desarrollado numerosas campañas y acciones para informar y prevenir la transmisión del VIH entre jóvenes, entre personas que practican la prostitución, entre el colectivo gay en general... sin olvidar que existen otras Infecciones de Transmisión Sexual que deben sacarse del tabú y merecen atención e información.

Pero la salud va más allá de la lucha con el SIDA: la inclusión de nuestras especificidades en la atención sanitaria primaria, la salud de las lesbianas, de las personas transexuales, de las personas mayores lgtb... son algunos de los temas presentes en nuestro trabajo.